梁清标生而颖异，读书目数行俱下，搦管成文，飙发泉涌。年十四，补诸生。明崇祯十五年，领乡荐，十六年，成进士，授翰林院庶吉士。福王时，因曾降附李自成，定入「从贼」案。　　清顺治元年降清，补原官，寻授编修，累迁礼部侍郎。畿辅岁饥，皇上分遣重臣往赈，梁清标巡历保定所属各州县，还奏称旨，调吏部侍郎。后因母丧归。　　顺治十三年，补授兵部尚书。时蒙古诸部长来朝，皇上目视梁清标谓之曰：此朕新用兵部尚书也。知遇之隆如此。江南提督马逢知素来桀骜不法，皇上命其进京陛见。马逢知按旧例赴兵部行跪拜礼，乃托梁清标求免，遭梁清标当面叱责。皇上闻之，谓侍臣曰：梁尚书不愧大臣距度。　　清康熙三年，辅臣以选人壅滞，议停科目，梁清标力争不可，卒得不罢，人谓其能持大体云。五年，改礼部，京察，罢职。八年，辅政大臣鳌拜获罪，诏梁清标复官，以刑部尚书起用，改户部，充经筵讲官。十九年，因星变陈言，奏免秦中运粮入川。二十一年，复旱，上问弭灾之方，梁清标以省刑对。寻兼兵部尚书事，拜保和殿大学士。是年，湖北巡抚张汧贪污事发，梁清标曾保举为布政使，部议革职，降三级留任。　　梁清标于康熙三十年卒，年七十二岁，祀乡贤。　　与河南睢州睢阳袁氏之袁赋诚、袁赋谌兄弟有交，故睢阳袁氏之藏品书画珍品流入梁氏者为多。