宋亡,终身不仕、不娶,及壮,自号(儒、佛、道)三教外人,又号九鉴山人,人称文行先生,淡泊名利,遍游名山。常在寺院闭门静坐,每日用饭一次。德祐元年(1275)至余杭洞霄宫,友人住山沈介石为建白鹿山房石室居住,匾曰空屋,旁植梅竹,和五松相间。平时不着布衣,以楮纸作服,常去超然馆静坐,有时竟数月不出,与里人叶林为至交。元元贞二年,王修竹延至山阴陶山书院。大德三年,入余杭洞霄,四方名胜多求其文。元大德九年(1305),朝廷派玄教大师吴全节请牧出山,断然拒绝。与南宋遗民谢翱、周密等友善,来往甚密,为翱作传,为密作《蜡屐集序》。十年卒,年六十。
著有《洞霄宫志》、《洞霄图志》、《大涤洞天记》、《游山志》、《杂文稿》等传世。精于古文,生前尝自编诗文六十余篇为《伯牙琴》,滔滔清辨而不失修洁,非晚宋诸人所及(《四库全书总目》卷一六五)。《伯牙琴》一卷补遗一卷,有清抄本、《知不足斋丛书》本,1959年中华书局标点本,1981年修订重印本。《全宋诗》卷三六八五录其诗十三首。事迹见《伯牙琴》卷首《邓文行先生传》。
老龙山中居,出山作霖雨。
风云几聚散,田野正辛苦。
神仙地位高,使尔司下土。
寒{石问}岂成蛟,流泉亦非翠。
色缘映带得,意出飞舞外。
虽无风霆化,自与江海会。
何年采真游,遗此栖遁迹。
流泉金石奏,伏鼠霜雪色。
浮世几兴亡,残棋耿苔石。
石岩千尺高,曾见坡仙来。
坡仙化黄土,岩石空苍苔。
县知今人游,复令后人哀。
阴阴大涤洞,古色閟积铁。
谁横一石碍,坐与三岛绝。
元同我先去,不见肝肺热。